舒心就医还款分为主动还款和自动还款。主动还款可以通过医院的自助机、健康通APP和指定的市民卡账户，进行一次性还款。自动还款是授权于与该账户绑定的借记卡银行，该卡会自动扣划款项进行还款。需要注意的是舒心就医不能通过支付宝进行还款，还款的APP有杭州健康通APP、杭州市民卡APP、杭州办事服务APP。